48小时超30Gb产出，N50破10Kb
一句话总结 CycloneSEQ-WT02纳米孔测序平台，凭借其出色稳健的硬件，简洁丰富的UI界面，与精心优化的测序流程，成功实现了对细菌基因组复杂重复区域的穿透，产出高质量长读长序列，有效推动基因组完成拼接与功能研究。
继上期开箱测评（【独家】全网首次国产三代测序仪开箱——华大序风WT02！）后，本次天意生信云继续联合山东第一医科大学李冕博士对华大智造（MGI）的CycloneSEQ-WT02纳米孔测序平台进行深入评测。本次测评选取了三株纯培养细菌，对其进行了从样本制备到数据产出的全面考察，核心结果显示：WT02在48小时内产出32.07 Gb高质量数据，读长N50达10.22 Kb。这篇报告将为您详细呈现评测过程与关键性能数据。
测试方案
样本类型：福氏志贺氏菌(SF)，纤维素类杆菌(BC)和迟缓埃格特菌(EL)三个纯培养细菌样本。
文库制备：CycloneSEQ 24条形码文库制备试剂套装
测序平台：CycloneSEQ-WT02
样本情况
提取试剂盒：TIANGEN细菌基因组DNA提取试剂盒(DP302)。
浓度纯度：所有样本都符合建库的DNA总量（45ul以内含1000ng）和纯度要求（表1）。
表1：三个细菌基因DNA提取浓度和纯度（SF和BC有重复）
基因组片段大小：通过DNA琼脂糖凝胶电泳，提取的细菌基因组主条带大于10Kb，且降解较少（图1）。
图1. 细菌基因组DNA琼脂糖凝胶电泳结果
最终文库片段大小：通过DNA琼脂糖凝胶电泳，最终混样测序文库主条带大于15Kb，且片段大小较为集中（图2）。
图2. 最终测序文库DNA琼脂糖凝胶电泳结果
上机测序参数设定
启动测序运行前，通过自带CycloneMaster的操作界面进行参数设置：
- 项目身份：定义项目名、文库名、操作员。
- 试剂选择：选择建库试剂 (CycloneSEQ 24 barcode) 和测序试剂 (Universal ReactionKit for Sequencing)。
- 运行策略：设定模式 (Single-End)、总时长 (48h)、数据收集周期 (每1h)。
- 数据格式：选择同时保存fastq和原始signal文件。
- 芯片与孵育：指定使用B芯片，并设定20分钟孵育时间。
参数确认无误后，点击“开始测序”按钮，CycloneSEQ-WT02便进入48小时的测序征程。
测序结果与性能剖析
三个细菌基因组混在一张WT测序芯片上，建库后使用CycloneSEQ-WT02测序。最终经过48小时的测定，测序结果如下：
- 总数据产出：共计产生 32.07 Gb 高质量测序数据。
- 统计数据：获得约 565万条 独立的测序Reads，平均碱基质量为10.63，关键的读长N50达到10.22 Kb，平均读长为5.67 Kb，充分体现了其优异的长读长测序能力。这对基因组组装和结构变异分析极为有利。
图3. 最终测序统计报告
样本均一性：由于采用条形码混合测序，我们评估了三个细菌样本的数据产出分布。结果显示，各样本的序列产量分布相对均匀，表明平台的混合测序流程和数据拆分算法具有良好的均一性和准确性。
图4. 每个barcode产出信息
数据质量：整体平均碱基质量（Phred Score）为 Q10.63。质量分布图显示，大部分Reads的碱基质量集中在Q11附近，这是一个对于当前纳米孔测序而言可靠的质量水平，数据可直接用于下游分析。
图5. 整体测序质量展示
芯片表现：整个48小时的测序过程中，测序蛋白孔的百分比或者测序孔蛋白的数量比较稳定，衰减较低（图6）。
图6. 孔蛋白的活性和可用情况
结论
综合本次对华大序风CycloneSEQ-WT02纳米孔测序平台的全面测评，我们得出以下结论：
- 性能稳定可靠：平台展现了稳定的运行表现和强大的长读长数据生产力。
- 数据指标优异：48小时产出超30 Gb数据，读长N50超10 Kb，数据质量满足常规分析要求。
- 混合测序效果良好：多样本混合测序表现出良好的均一性。
- 数据产出稳定：测序孔活跃度衰减低，数据产出持续稳健。
这些特性使其成为研究细菌基因组、开展宏基因组分析以及探索其他需要长读长信息的生物学问题的有力工具，尤其在追求基因组完成图的目标上，展现出巨大的应用潜力。
本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划，分享自微信公众号。原始发表：2025-04-29，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent 删除数据芯片性能硬件工具
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