服务器jupyterlab的配置

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前言

随着生物信息学技术和AI技术的发展，python以更快的运行速度和更少的内存占用率越来越受到欢迎。

卡卡与时俱进，更新R语言时会同步更新python的内容！

python的教程基本说是从0开始的，所以适合任何想从python入手生物信息学的小白！

今天卡卡带着大家从服务器上配置jupyterlab开始。

实战

conda安装配置

conda想必大家都非常熟悉，前期可以自己安装配置一下，卡卡带着大家从配置镜像源开始：（亲测下载速度很快）

进入condarc文件

代码语言：bash复制
vim ~/.condarc

输入以下命令

代码语言：bash复制
channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - 
  - 
  - 
custom_channels:
  conda-forge: 
  pytorch:

创建jupyterlab虚拟环境，安装

代码语言：bash复制
conda create -n jupyterlab
conda activate jupyterlab
conda install numpy matplotlib pandas jupyterlab

配置jupyterlab

生成配置文件

代码语言：bash复制
jupyter lab --generate-config

修改配置文件:

代码语言：bash复制
vim /home/sxyd/.jupyter/jupyter_lab_config.py
c.NotebookApp.ip = '0.0.0.0'  
c.NotebookApp.open_browser = False  
c.NotebookApp.port = 8899  
c.MappingKernelManager.root_dir = '/home/sxyd' #需保证此目录存在  
c.NotebookApp.allow_remote_access = True

将jupyterlab当作服务运行

新建一个systemd服务文件

代码语言：bash复制
sudo nano /etc/systemd/system/jupyterlab.service

编辑输入以下内容:

代码语言：bash复制
[Unit]
Description=JupyterLab Service

[Service]
Type=simple
PIDFile=/run/jupyter.pid
ExecStart=/home/sxyd/miniconda3/envs/jupyterlab/bin/jupyter lab --config=/home/sxyd/.jupyter/jupyter_lab_config.py
User=sxyd
Group=sxyd
WorkingDirectory=/home/sxyd/
Restart=always
RestartSec=10

[Install]
WantedBy=multi-user.target

启动jupyterlab服务

代码语言：bash复制
# Reload systemd manager configuration 
sudo systemctl daemon-reload
# Start the JupyterLab service immediately 
sudo systemctl start jupyterlab 
# Enable the service to start automatically at boot 
sudo systemctl enable jupyterlab 
# Check the service status (optional) 
systemctl status jupyterlab

有时候可能会要求输入token，根据实际输出的内容，将token输入进行即可

汉化

代码语言：bash复制
pip install jupyterlab-language-pack-zh-CN

结束语

环境配置的内容到此就结束啦！接下来就可以愉快的学习和使用python了